心臟病指的是心臟的結構或功能發生異常，使正常的血液動力學發生改變。而這些心臟病又可分為「先天性」（出生前就有的異常）或「後天性」（出生後才得的異常）。
兒童心臟病包含「非發紺性先天性心臟病」，例如：心房中隔缺損（ASD）、心室中隔缺損（VSD）、開放性動脈導管（PDA）、心內膜墊缺損（ECD）；「發紺性先天性心臟病」，例如：法洛氏四重症（TOF）、三尖瓣閉鎖（TA）、大動脈轉位（TGA）等；阻塞性先天性心臟病：肺動脈瓣狹窄（PS）、主動脈瓣狹窄（AS）、主動脈窄縮（CoA）等，另外還有其他先天複雜性心臟病及後天性的心臟病，例如：川崎氏病、風濕性心臟病、心肌炎、肺高壓、開放性卵圓孔導致中風等，都是本科主治的項目。
本科透過專業技術及檢查，例如心臟超音波、心電圖、心臟電腦斷層掃描、心臟核磁共振攝影、心導管檢查等給予及時的正確診斷，加上技術超前的介入性心導管手術及開心手術的能力，因此本院能成為台灣中部先天性心臟病的醫療重鎮，也是中部醫學中心執行複雜性先天性心臟病手術的佼佼者。
我們提供介入性（治療性）心導管術，包括氣球導管術、螺旋彈簧絲圈栓塞術、支架血管撐開術、心房中隔缺損閉合術、肺動脈閉鎖刺穿術、開放性卵圓孔修補等治療，都有優秀的成績，例如，世界首例微小彈簧圈治療殘存動脈導管，解決早產兒最常見的心臟衰竭原因。
兒童心臟科及兒童心臟重症團隊推動「先天性心臟病重難症病童的計畫性醫療與整合照顧」(The Planning Management and Multidisciplinary Care in Children of Severe Congenital Heart Disease) 榮獲衛生福利部104~106年度的「兒科重難症醫療照護團隊獎勵方案計畫」，編列個案管理師與專任研究助理，聯合本院各專科全力推動重症心臟病童的整合醫療與照顧。
本院為中部心臟重症照護的後送醫學中心，提供複查性心臟病輔以人工心臟「體外循環膜肺維生系統（葉克膜ECMO）」，提供兒童專用的設備與兒童加護病房。
以介入性心導管治療不明原因中風合併開放性卵圓孔，接受中風成人病人轉診，注重次級預防的超前部屬，設有「成人先天性心臟病特別門診」。
複雜先天與結構異常的心臟病往往需要專業整合型的心臟團隊，包含兒童心臟科醫師、兒童心臟外科醫師、兒童重症醫師、心臟麻醉科醫師、心臟影像學醫師、兒童復健科醫師、社工師、兒童心理師、藝術治療師等組成，從病童出生開始就接手照顧，擬定治療計畫，分階段進行心臟手術，以「病患為中心」的治療方針甚至到成人時期都還再進行中。本科結合全國少數能施行心臟移植的兒童心臟外科團隊，提供多項複雜性結構心臟病手術。先天結構心臟病手術治療預後與美國兒童醫院平均預後並駕齊驅。
張正成醫師率領的團隊與中研院及其他醫院合作於2012年3月率先全球發現川崎氏病的致病基因BLK和CD40。2016年4月首先發現蛋白生物標記IP-10能早期偵測出川崎氏症。
我們積極與國內外醫學中心的兒童心臟科、心臟外科交流研究，全面優化診治幼兒心臟病的醫療品質，強化兒童加護病房照護病童於開心手術前後的醫療服務，以及提升照護兒童急重症的水準，使病童得到最佳的治療成效。
